Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN1Q05586 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN1Q05586 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN1Q05586 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN1Q05586 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN1Q05586 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms