Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MUC3AQ02505 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MUC3AQ02505 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC3AQ02505 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUC3AQ02505 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms