Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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