Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STX17P56962 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX17P56962 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STX17P56962 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX17P56962 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX17P56962 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX17P56962 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STX17P56962 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
STX17P56962 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STX17P56962 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STX17P56962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STX17P56962 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STX17P56962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX17P56962 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX17P56962 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX17P56962 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX17P56962 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX17P56962 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX17P56962 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX17P56962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX17P56962 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX17P56962 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX17P56962 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX17P56962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX17P56962 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX17P56962 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX17P56962 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX17P56962 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX17P56962 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STX17P56962 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX17P56962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX17P56962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX17P56962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
STX17P56962 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX17P56962 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX17P56962 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX17P56962 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX17P56962 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX17P56962 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX17P56962 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX17P56962 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STX17P56962 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX17P56962 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX17P56962 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX17P56962 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX17P56962 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX17P56962 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STX17P56962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX17P56962 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STX17P56962 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
STX17P56962 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX17P56962 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX17P56962 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX17P56962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STX17P56962 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX17P56962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX17P56962 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX17P56962 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX17P56962 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX17P56962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX17P56962 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX17P56962 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STX17P56962 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX17P56962 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STX17P56962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX17P56962 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX17P56962 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX17P56962 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX17P56962 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX17P56962 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX17P56962 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX17P56962 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX17P56962 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX17P56962 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX17P56962 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms