Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PER3P56645 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PER3P56645 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PER3P56645 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PER3P56645 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PER3P56645 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PER3P56645 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PER3P56645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PER3P56645 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PER3P56645 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PER3P56645 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PER3P56645 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PER3P56645 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PER3P56645 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PER3P56645 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PER3P56645 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PER3P56645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PER3P56645 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PER3P56645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PER3P56645 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PER3P56645 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PER3P56645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PER3P56645 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PER3P56645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PER3P56645 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PER3P56645 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PER3P56645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PER3P56645 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PER3P56645 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PER3P56645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PER3P56645 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PER3P56645 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PER3P56645 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PER3P56645 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PER3P56645 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PER3P56645 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PER3P56645 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PER3P56645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PER3P56645 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER3P56645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER3P56645 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER3P56645 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PER3P56645 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER3P56645 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER3P56645 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PER3P56645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER3P56645 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER3P56645 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER3P56645 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER3P56645 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PER3P56645 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PER3P56645 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PER3P56645 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PER3P56645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PER3P56645 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PER3P56645 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PER3P56645 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PER3P56645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PER3P56645 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PER3P56645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PER3P56645 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PER3P56645 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PER3P56645 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PER3P56645 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PER3P56645 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PER3P56645 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PER3P56645 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PER3P56645 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms