Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME5P56597 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME5P56597 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME5P56597 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME5P56597 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME5P56597 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME5P56597 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME5P56597 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME5P56597 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME5P56597 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME5P56597 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME5P56597 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME5P56597 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME5P56597 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME5P56597 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME5P56597 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME5P56597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME5P56597 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME5P56597 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME5P56597 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME5P56597 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME5P56597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME5P56597 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME5P56597 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME5P56597 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME5P56597 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME5P56597 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME5P56597 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME5P56597 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME5P56597 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME5P56597 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME5P56597 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME5P56597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME5P56597 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME5P56597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME5P56597 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME5P56597 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME5P56597 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME5P56597 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME5P56597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME5P56597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME5P56597 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME5P56597 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME5P56597 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME5P56597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME5P56597 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME5P56597 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME5P56597 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME5P56597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME5P56597 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME5P56597 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME5P56597 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME5P56597 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME5P56597 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME5P56597 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME5P56597 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME5P56597 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME5P56597 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME5P56597 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME5P56597 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME5P56597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NME5P56597 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME5P56597 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME5P56597 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME5P56597 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME5P56597 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME5P56597 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME5P56597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME5P56597 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME5P56597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME5P56597 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME5P56597 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME5P56597 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NME5P56597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME5P56597 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME5P56597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME5P56597 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms