Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DAP3P51398 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DAP3P51398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DAP3P51398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DAP3P51398 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DAP3P51398 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DAP3P51398 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DAP3P51398 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DAP3P51398 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DAP3P51398 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DAP3P51398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DAP3P51398 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DAP3P51398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DAP3P51398 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DAP3P51398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DAP3P51398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DAP3P51398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DAP3P51398 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DAP3P51398 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DAP3P51398 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DAP3P51398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DAP3P51398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DAP3P51398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DAP3P51398 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DAP3P51398 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DAP3P51398 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DAP3P51398 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DAP3P51398 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DAP3P51398 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DAP3P51398 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DAP3P51398 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DAP3P51398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DAP3P51398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DAP3P51398 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DAP3P51398 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DAP3P51398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DAP3P51398 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DAP3P51398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DAP3P51398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DAP3P51398 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DAP3P51398 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DAP3P51398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DAP3P51398 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DAP3P51398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DAP3P51398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DAP3P51398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DAP3P51398 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DAP3P51398 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DAP3P51398 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DAP3P51398 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DAP3P51398 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DAP3P51398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DAP3P51398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DAP3P51398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DAP3P51398 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DAP3P51398 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DAP3P51398 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms