Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CX3CR1P49238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CX3CR1P49238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CX3CR1P49238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CX3CR1P49238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms