Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFMP43652 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFMP43652 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFMP43652 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AFMP43652 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFMP43652 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AFMP43652 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
AFMP43652 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFMP43652 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AFMP43652 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
AFMP43652 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFMP43652 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFMP43652 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFMP43652 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFMP43652 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFMP43652 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFMP43652 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFMP43652 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFMP43652 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFMP43652 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFMP43652 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFMP43652 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFMP43652 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFMP43652 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFMP43652 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFMP43652 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFMP43652 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFMP43652 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFMP43652 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFMP43652 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFMP43652 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFMP43652 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFMP43652 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFMP43652 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFMP43652 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFMP43652 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFMP43652 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFMP43652 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFMP43652 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFMP43652 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFMP43652 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AFMP43652 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFMP43652 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFMP43652 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFMP43652 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFMP43652 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AFMP43652 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFMP43652 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFMP43652 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFMP43652 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFMP43652 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFMP43652 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFMP43652 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFMP43652 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFMP43652 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFMP43652 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFMP43652 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFMP43652 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AFMP43652 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFMP43652 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFMP43652 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AFMP43652 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms