Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF5P43026 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF5P43026 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF5P43026 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF5P43026 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF5P43026 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF5P43026 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF5P43026 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF5P43026 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF5P43026 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF5P43026 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF5P43026 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF5P43026 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF5P43026 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF5P43026 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF5P43026 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF5P43026 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF5P43026 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF5P43026 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF5P43026 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF5P43026 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF5P43026 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF5P43026 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF5P43026 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF5P43026 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF5P43026 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF5P43026 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF5P43026 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF5P43026 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF5P43026 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF5P43026 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF5P43026 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF5P43026 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF5P43026 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF5P43026 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF5P43026 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF5P43026 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF5P43026 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF5P43026 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF5P43026 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF5P43026 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF5P43026 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF5P43026 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF5P43026 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF5P43026 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF5P43026 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF5P43026 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF5P43026 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF5P43026 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF5P43026 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF5P43026 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF5P43026 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF5P43026 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF5P43026 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF5P43026 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF5P43026 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF5P43026 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF5P43026 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF5P43026 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF5P43026 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF5P43026 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF5P43026 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF5P43026 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF5P43026 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF5P43026 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF5P43026 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF5P43026 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF5P43026 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF5P43026 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF5P43026 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF5P43026 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF5P43026 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF5P43026 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF5P43026 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF5P43026 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF5P43026 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms