Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HALP42357 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HALP42357 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HALP42357 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HALP42357 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HALP42357 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HALP42357 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HALP42357 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HALP42357 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HALP42357 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HALP42357 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HALP42357 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HALP42357 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HALP42357 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HALP42357 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HALP42357 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HALP42357 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HALP42357 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HALP42357 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HALP42357 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HALP42357 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HALP42357 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HALP42357 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HALP42357 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HALP42357 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HALP42357 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HALP42357 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HALP42357 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HALP42357 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HALP42357 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HALP42357 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HALP42357 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HALP42357 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HALP42357 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HALP42357 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HALP42357 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HALP42357 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HALP42357 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HALP42357 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HALP42357 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HALP42357 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HALP42357 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HALP42357 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HALP42357 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HALP42357 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HALP42357 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HALP42357 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HALP42357 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HALP42357 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HALP42357 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HALP42357 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HALP42357 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HALP42357 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HALP42357 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HALP42357 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HALP42357 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HALP42357 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HALP42357 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HALP42357 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HALP42357 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HALP42357 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HALP42357 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HALP42357 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HALP42357 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HALP42357 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HALP42357 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HALP42357 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HALP42357 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HALP42357 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HALP42357 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HALP42357 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HALP42357 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HALP42357 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HALP42357 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HALP42357 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HALP42357 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HALP42357 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HALP42357 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HALP42357 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HALP42357 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HALP42357 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HALP42357 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HALP42357 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms