Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FDFT1P37268 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FDFT1P37268 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FDFT1P37268 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FDFT1P37268 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms