Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E1P36543 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E1P36543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E1P36543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms