Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX5P35711 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX5P35711 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX5P35711 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX5P35711 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX5P35711 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX5P35711 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX5P35711 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX5P35711 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX5P35711 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX5P35711 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX5P35711 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX5P35711 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX5P35711 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX5P35711 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX5P35711 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX5P35711 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX5P35711 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX5P35711 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX5P35711 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX5P35711 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX5P35711 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX5P35711 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX5P35711 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX5P35711 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX5P35711 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX5P35711 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOX5P35711 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX5P35711 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX5P35711 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX5P35711 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX5P35711 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX5P35711 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX5P35711 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX5P35711 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX5P35711 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX5P35711 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX5P35711 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX5P35711 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX5P35711 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX5P35711 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX5P35711 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX5P35711 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SOX5P35711 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX5P35711 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX5P35711 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX5P35711 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX5P35711 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX5P35711 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX5P35711 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX5P35711 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX5P35711 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX5P35711 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX5P35711 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX5P35711 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX5P35711 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX5P35711 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX5P35711 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX5P35711 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX5P35711 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX5P35711 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX5P35711 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX5P35711 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX5P35711 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX5P35711 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX5P35711 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX5P35711 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX5P35711 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX5P35711 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms