Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNA1P35221 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA1P35221 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNA1P35221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms