Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP1P32455 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GBP1P32455 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GBP1P32455 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP1P32455 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP1P32455 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP1P32455 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP1P32455 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP1P32455 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP1P32455 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP1P32455 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP1P32455 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP1P32455 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP1P32455 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP1P32455 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP1P32455 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP1P32455 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP1P32455 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP1P32455 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP1P32455 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP1P32455 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP1P32455 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP1P32455 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP1P32455 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP1P32455 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBP1P32455 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBP1P32455 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP1P32455 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP1P32455 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP1P32455 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP1P32455 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP1P32455 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP1P32455 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP1P32455 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP1P32455 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP1P32455 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP1P32455 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP1P32455 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP1P32455 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP1P32455 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP1P32455 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP1P32455 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GBP1P32455 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP1P32455 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP1P32455 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP1P32455 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP1P32455 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP1P32455 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP1P32455 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP1P32455 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP1P32455 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP1P32455 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP1P32455 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP1P32455 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP1P32455 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP1P32455 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP1P32455 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP1P32455 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP1P32455 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP1P32455 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP1P32455 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP1P32455 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP1P32455 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP1P32455 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GBP1P32455 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP1P32455 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP1P32455 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP1P32455 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBP1P32455 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP1P32455 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP1P32455 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP1P32455 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBP1P32455 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBP1P32455 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms