Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXC8P31273 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXC8P31273 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC8P31273 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC8P31273 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms