Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRABP1P29762 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRABP1P29762 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRABP1P29762 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms