Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB2P29033 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB2P29033 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB2P29033 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJB2P29033 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB2P29033 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB2P29033 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB2P29033 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB2P29033 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB2P29033 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB2P29033 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB2P29033 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB2P29033 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB2P29033 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB2P29033 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB2P29033 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB2P29033 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB2P29033 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB2P29033 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB2P29033 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJB2P29033 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJB2P29033 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJB2P29033 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJB2P29033 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB2P29033 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB2P29033 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB2P29033 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB2P29033 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB2P29033 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB2P29033 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB2P29033 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB2P29033 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB2P29033 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB2P29033 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB2P29033 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB2P29033 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB2P29033 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJB2P29033 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB2P29033 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJB2P29033 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB2P29033 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB2P29033 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB2P29033 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB2P29033 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB2P29033 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB2P29033 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB2P29033 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB2P29033 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB2P29033 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB2P29033 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB2P29033 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB2P29033 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJB2P29033 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GJB2P29033 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJB2P29033 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB2P29033 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB2P29033 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB2P29033 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB2P29033 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB2P29033 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB2P29033 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB2P29033 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB2P29033 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB2P29033 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB2P29033 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJB2P29033 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB2P29033 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB2P29033 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB2P29033 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB2P29033 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB2P29033 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GJB2P29033 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB2P29033 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB2P29033 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB2P29033 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB2P29033 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB2P29033 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB2P29033 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB2P29033 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJB2P29033 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB2P29033 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB2P29033 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB2P29033 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB2P29033 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB2P29033 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB2P29033 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB2P29033 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms