Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45AP24522 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45AP24522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GADD45AP24522 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms