Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPH2P23942 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPH2P23942 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPH2P23942 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms