Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACBP22694 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACBP22694 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKACBP22694 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKACBP22694 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms