Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC1P18754 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RCC1P18754 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC1P18754 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC1P18754 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCC1P18754 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCC1P18754 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCC1P18754 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RCC1P18754 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCC1P18754 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RCC1P18754 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC1P18754 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC1P18754 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RCC1P18754 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC1P18754 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCC1P18754 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCC1P18754 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCC1P18754 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCC1P18754 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC1P18754 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC1P18754 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCC1P18754 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCC1P18754 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCC1P18754 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCC1P18754 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCC1P18754 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCC1P18754 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCC1P18754 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCC1P18754 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCC1P18754 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCC1P18754 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCC1P18754 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCC1P18754 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCC1P18754 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCC1P18754 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCC1P18754 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCC1P18754 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCC1P18754 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RCC1P18754 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RCC1P18754 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCC1P18754 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCC1P18754 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCC1P18754 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCC1P18754 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCC1P18754 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCC1P18754 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCC1P18754 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RCC1P18754 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCC1P18754 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCC1P18754 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCC1P18754 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCC1P18754 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCC1P18754 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RCC1P18754 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RCC1P18754 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RCC1P18754 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RCC1P18754 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms