Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VCANP13611 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VCANP13611 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCANP13611 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCANP13611 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCANP13611 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCANP13611 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCANP13611 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCANP13611 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCANP13611 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCANP13611 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCANP13611 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCANP13611 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCANP13611 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCANP13611 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCANP13611 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCANP13611 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VCANP13611 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCANP13611 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCANP13611 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCANP13611 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCANP13611 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCANP13611 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCANP13611 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCANP13611 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCANP13611 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCANP13611 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCANP13611 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCANP13611 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VCANP13611 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCANP13611 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCANP13611 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCANP13611 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCANP13611 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCANP13611 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCANP13611 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCANP13611 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCANP13611 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCANP13611 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCANP13611 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCANP13611 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCANP13611 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCANP13611 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
VCANP13611 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VCANP13611 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCANP13611 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCANP13611 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCANP13611 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCANP13611 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCANP13611 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCANP13611 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCANP13611 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCANP13611 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VCANP13611 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCANP13611 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCANP13611 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCANP13611 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCANP13611 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCANP13611 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCANP13611 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VCANP13611 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCANP13611 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VCANP13611 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCANP13611 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCANP13611 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCANP13611 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VCANP13611 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCANP13611 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCANP13611 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms