Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNAP12004 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNAP12004 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNAP12004 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNAP12004 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNAP12004 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNAP12004 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNAP12004 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNAP12004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNAP12004 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNAP12004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNAP12004 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNAP12004 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNAP12004 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNAP12004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNAP12004 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNAP12004 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNAP12004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNAP12004 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNAP12004 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNAP12004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNAP12004 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNAP12004 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNAP12004 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNAP12004 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNAP12004 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNAP12004 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNAP12004 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNAP12004 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNAP12004 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNAP12004 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNAP12004 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNAP12004 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNAP12004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNAP12004 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNAP12004 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNAP12004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNAP12004 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNAP12004 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNAP12004 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNAP12004 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNAP12004 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNAP12004 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNAP12004 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNAP12004 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNAP12004 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNAP12004 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNAP12004 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNAP12004 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNAP12004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNAP12004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNAP12004 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNAP12004 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNAP12004 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNAP12004 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNAP12004 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNAP12004 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNAP12004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNAP12004 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNAP12004 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNAP12004 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNAP12004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNAP12004 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms