Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ESRRAP11474 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ESRRAP11474 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESRRAP11474 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRAP11474 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESRRAP11474 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms