Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPSAP08865 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPSAP08865 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPSAP08865 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPSAP08865 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPSAP08865 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPSAP08865 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPSAP08865 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPSAP08865 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPSAP08865 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPSAP08865 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPSAP08865 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPSAP08865 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPSAP08865 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPSAP08865 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPSAP08865 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPSAP08865 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPSAP08865 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPSAP08865 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPSAP08865 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPSAP08865 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPSAP08865 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPSAP08865 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPSAP08865 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPSAP08865 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPSAP08865 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPSAP08865 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPSAP08865 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPSAP08865 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPSAP08865 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPSAP08865 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPSAP08865 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPSAP08865 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPSAP08865 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPSAP08865 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPSAP08865 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPSAP08865 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPSAP08865 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPSAP08865 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPSAP08865 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPSAP08865 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPSAP08865 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPSAP08865 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPSAP08865 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPSAP08865 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPSAP08865 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPSAP08865 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPSAP08865 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPSAP08865 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPSAP08865 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPSAP08865 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPSAP08865 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPSAP08865 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPSAP08865 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPSAP08865 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPSAP08865 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPSAP08865 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPSAP08865 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPSAP08865 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPSAP08865 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPSAP08865 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPSAP08865 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPSAP08865 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPSAP08865 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPSAP08865 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPSAP08865 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPSAP08865 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPSAP08865 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPSAP08865 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPSAP08865 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms