Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS1P07996 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THBS1P07996 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THBS1P07996 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS1P07996 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS1P07996 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS1P07996 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS1P07996 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS1P07996 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS1P07996 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS1P07996 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS1P07996 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS1P07996 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THBS1P07996 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS1P07996 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS1P07996 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS1P07996 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS1P07996 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THBS1P07996 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS1P07996 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS1P07996 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS1P07996 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THBS1P07996 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THBS1P07996 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS1P07996 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS1P07996 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS1P07996 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THBS1P07996 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS1P07996 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS1P07996 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS1P07996 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS1P07996 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS1P07996 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS1P07996 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS1P07996 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS1P07996 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS1P07996 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS1P07996 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS1P07996 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS1P07996 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS1P07996 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS1P07996 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS1P07996 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS1P07996 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS1P07996 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS1P07996 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS1P07996 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS1P07996 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS1P07996 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS1P07996 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS1P07996 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS1P07996 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS1P07996 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS1P07996 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS1P07996 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS1P07996 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS1P07996 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS1P07996 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms