Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLBP06746 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLBP06746 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLBP06746 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLBP06746 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLBP06746 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLBP06746 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLBP06746 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLBP06746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLBP06746 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLBP06746 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLBP06746 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLBP06746 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLBP06746 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLBP06746 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLBP06746 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLBP06746 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLBP06746 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLBP06746 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLBP06746 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLBP06746 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLBP06746 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLBP06746 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLBP06746 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLBP06746 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLBP06746 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLBP06746 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLBP06746 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLBP06746 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLBP06746 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLBP06746 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLBP06746 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLBP06746 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLBP06746 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLBP06746 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLBP06746 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLBP06746 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLBP06746 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLBP06746 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLBP06746 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLBP06746 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLBP06746 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLBP06746 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLBP06746 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLBP06746 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLBP06746 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLBP06746 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLBP06746 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLBP06746 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLBP06746 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLBP06746 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLBP06746 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLBP06746 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLBP06746 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLBP06746 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLBP06746 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLBP06746 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLBP06746 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLBP06746 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLBP06746 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLBP06746 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLBP06746 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLBP06746 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLBP06746 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLBP06746 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLBP06746 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLBP06746 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms