Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP1A1P05023 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A1P05023 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A1P05023 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP1A1P05023 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A1P05023 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms