Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPXO76031 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPXO76031 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPXO76031 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPXO76031 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPXO76031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPXO76031 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPXO76031 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPXO76031 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPXO76031 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPXO76031 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPXO76031 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPXO76031 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPXO76031 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPXO76031 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPXO76031 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPXO76031 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPXO76031 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPXO76031 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPXO76031 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLPXO76031 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPXO76031 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPXO76031 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPXO76031 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPXO76031 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPXO76031 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPXO76031 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPXO76031 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPXO76031 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPXO76031 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPXO76031 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPXO76031 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPXO76031 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPXO76031 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPXO76031 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPXO76031 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPXO76031 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPXO76031 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPXO76031 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPXO76031 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPXO76031 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPXO76031 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPXO76031 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPXO76031 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPXO76031 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPXO76031 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPXO76031 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPXO76031 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPXO76031 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPXO76031 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPXO76031 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPXO76031 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPXO76031 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPXO76031 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPXO76031 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPXO76031 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPXO76031 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPXO76031 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPXO76031 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPXO76031 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms