Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCATO75600 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCATO75600 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCATO75600 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCATO75600 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCATO75600 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCATO75600 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCATO75600 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCATO75600 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCATO75600 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCATO75600 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCATO75600 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCATO75600 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCATO75600 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCATO75600 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCATO75600 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCATO75600 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCATO75600 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GCATO75600 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCATO75600 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCATO75600 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCATO75600 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCATO75600 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCATO75600 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCATO75600 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCATO75600 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCATO75600 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCATO75600 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCATO75600 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCATO75600 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCATO75600 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCATO75600 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCATO75600 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCATO75600 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCATO75600 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCATO75600 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCATO75600 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCATO75600 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCATO75600 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCATO75600 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCATO75600 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCATO75600 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCATO75600 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCATO75600 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCATO75600 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCATO75600 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCATO75600 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCATO75600 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCATO75600 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCATO75600 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCATO75600 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCATO75600 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCATO75600 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCATO75600 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCATO75600 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCATO75600 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCATO75600 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCATO75600 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCATO75600 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCATO75600 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCATO75600 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCATO75600 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GCATO75600 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCATO75600 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCATO75600 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCATO75600 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms