Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA2O75334 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA2O75334 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA2O75334 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA2O75334 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms