Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDSO60760 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPGDSO60760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPGDSO60760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms