Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HPGDSO60760 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HPGDSO60760 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HPGDSO60760 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HPGDSO60760 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPGDSO60760 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPGDSO60760 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPGDSO60760 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HPGDSO60760 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPGDSO60760 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPGDSO60760 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPGDSO60760 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPGDSO60760 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPGDSO60760 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HPGDSO60760 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPGDSO60760 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPGDSO60760 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPGDSO60760 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPGDSO60760 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPGDSO60760 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPGDSO60760 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPGDSO60760 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPGDSO60760 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPGDSO60760 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPGDSO60760 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPGDSO60760 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPGDSO60760 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPGDSO60760 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HPGDSO60760 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPGDSO60760 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HPGDSO60760 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPGDSO60760 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HPGDSO60760 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPGDSO60760 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPGDSO60760 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPGDSO60760 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPGDSO60760 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPGDSO60760 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPGDSO60760 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPGDSO60760 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPGDSO60760 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPGDSO60760 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPGDSO60760 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPGDSO60760 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPGDSO60760 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPGDSO60760 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPGDSO60760 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPGDSO60760 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPGDSO60760 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPGDSO60760 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPGDSO60760 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPGDSO60760 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPGDSO60760 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPGDSO60760 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDSO60760 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPGDSO60760 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPGDSO60760 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPGDSO60760 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPGDSO60760 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPGDSO60760 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPGDSO60760 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPGDSO60760 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPGDSO60760 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPGDSO60760 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPGDSO60760 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPGDSO60760 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPGDSO60760 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPGDSO60760 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPGDSO60760 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPGDSO60760 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPGDSO60760 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPGDSO60760 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPGDSO60760 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPGDSO60760 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPGDSO60760 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPGDSO60760 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPGDSO60760 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPGDSO60760 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPGDSO60760 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPGDSO60760 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPGDSO60760 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPGDSO60760 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPGDSO60760 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPGDSO60760 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms