Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDH7O60245 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH7O60245 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH7O60245 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH7O60245 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH7O60245 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms