Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GATCO43716 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GATCO43716 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATCO43716 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATCO43716 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATCO43716 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GATCO43716 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GATCO43716 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GATCO43716 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GATCO43716 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GATCO43716 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GATCO43716 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GATCO43716 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GATCO43716 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATCO43716 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATCO43716 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATCO43716 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATCO43716 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GATCO43716 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GATCO43716 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GATCO43716 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GATCO43716 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GATCO43716 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GATCO43716 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GATCO43716 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATCO43716 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATCO43716 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATCO43716 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATCO43716 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATCO43716 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATCO43716 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GATCO43716 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATCO43716 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATCO43716 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATCO43716 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATCO43716 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATCO43716 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATCO43716 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATCO43716 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATCO43716 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATCO43716 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATCO43716 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GATCO43716 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GATCO43716 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms