Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID2O43424 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID2O43424 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRID2O43424 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID2O43424 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID2O43424 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID2O43424 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID2O43424 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID2O43424 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID2O43424 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID2O43424 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID2O43424 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID2O43424 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID2O43424 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID2O43424 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRID2O43424 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRID2O43424 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRID2O43424 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRID2O43424 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID2O43424 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID2O43424 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID2O43424 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRID2O43424 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID2O43424 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID2O43424 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID2O43424 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID2O43424 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRID2O43424 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRID2O43424 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRID2O43424 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID2O43424 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID2O43424 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID2O43424 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID2O43424 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID2O43424 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID2O43424 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID2O43424 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID2O43424 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID2O43424 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID2O43424 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID2O43424 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID2O43424 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID2O43424 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID2O43424 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID2O43424 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID2O43424 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID2O43424 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID2O43424 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRID2O43424 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRID2O43424 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID2O43424 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID2O43424 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID2O43424 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID2O43424 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms