Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP26A1O43174 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP26A1O43174 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP26A1O43174 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26A1O43174 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26A1O43174 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26A1O43174 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26A1O43174 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26A1O43174 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26A1O43174 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26A1O43174 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms