Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASKO14936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKO14936 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKO14936 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKO14936 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKO14936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASKO14936 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASKO14936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKO14936 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKO14936 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKO14936 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKO14936 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASKO14936 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKO14936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKO14936 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKO14936 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKO14936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASKO14936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKO14936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKO14936 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKO14936 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKO14936 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKO14936 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKO14936 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKO14936 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKO14936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKO14936 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKO14936 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKO14936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKO14936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKO14936 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKO14936 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKO14936 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKO14936 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKO14936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKO14936 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKO14936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKO14936 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKO14936 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKO14936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKO14936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKO14936 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKO14936 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKO14936 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKO14936 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKO14936 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKO14936 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKO14936 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKO14936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKO14936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKO14936 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKO14936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKO14936 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKO14936 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKO14936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms