Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ASTN1O14525 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ASTN1O14525 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ASTN1O14525 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASTN1O14525 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms