Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN6O00399 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN6O00399 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN6O00399 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms