Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KRW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KRW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KRW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KRW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KRW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3KRW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3KRW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3KRW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3KRW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
J3KRW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3KRW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
J3KRW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
J3KRW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3KRW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3KRW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KRW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KRW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KRW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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