Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf98E9PRG8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf98E9PRG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C11orf98E9PRG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf98E9PRG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf98E9PRG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms