Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB8E9PQR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPB8E9PQR5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPIPB8E9PQR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB8E9PQR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms