Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYSRT1A8MQ03 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYSRT1A8MQ03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYSRT1A8MQ03 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYSRT1A8MQ03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms