Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD8B2A6NJW9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD8B2A6NJW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD8B2A6NJW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8B2A6NJW9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms