Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP73A6NFT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP73A6NFT4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP73A6NFT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms