Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6BA6NDN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6BA6NDN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms