Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49BA6NDI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49BA6NDI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49BA6NDI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49BA6NDI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms